只有女性能使用的世界最强兵器「IS」在日本公布开发以后，世界也处于了女尊男卑的状态。培育 IS 操纵者的学校「IS 学园」是，集合来自世界各地的代表候补生少女的女子学校。然而，主角「织斑一夏」虽然身为男生却不知什么原因能够起动 IS，为此他被强制送进「IS 学园」上学。女子学院里唯一的男生，穿插于以青梅竹马的剑道少女箒为首，不同国籍各色各样的少女们当中，疾风怒号的战斗与恋爱生活。 突然袭击而来的敌人，IS所隐藏的秘密，还有围绕于一夏身边的少女们的前路将会！